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養(yǎng)豬業(yè)是我國畜牧業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)，培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病的優(yōu)良種豬是實現(xiàn)我國養(yǎng)豬業(yè)可持續(xù)發(fā)展的根本保障。近年來，我國在豬生長、肉質(zhì)和抗病性狀的功能基因組研究領域取得了一批具有國際影響力的成果，但在豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因分離與鑒定、基因網(wǎng)絡調(diào)控、功能基因組學平臺構(gòu)建等方面還較欠缺，不能滿足我國豬品種改良及豬分子設計育種的需求。2013年，863計劃現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術領域啟動了“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學研究”課題。2015年7月17日，科技部組織有關專家對該課題進行了中期檢查。

“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學研究”課題啟動以來，課題組針對我國養(yǎng)豬業(yè)的可持續(xù)發(fā)展對功能基因組學新成果、新技術的戰(zhàn)略性需求，以生長、肉質(zhì)、抗病等性狀進行功能基因組學解析、豬大規(guī)模突變品系的創(chuàng)建等為重點研究內(nèi)容，完成了超過2000頭豬不同性狀測定數(shù)據(jù)的收集，并完成了榮昌豬、藏豬等20多個中國地方豬種的基因組（重）測序工作。通過數(shù)據(jù)分析，課題組鑒定出了在不同豬種中受選擇的區(qū)域或基因，基于藏豬的基因組測序分析揭示出藏豬特殊環(huán)境適應性進化的組學機制，相關研究成果在國際知名期刊NatureGenetics的發(fā)表。同時，課題組選用piggyBac轉(zhuǎn)座子載體pZG，將pZG質(zhì)粒和pCAG-4PB-ineo質(zhì)粒共同電轉(zhuǎn)并進行流式分選GFP陽性細胞作為供體，獲得了pZG陽性豬和健康的pCAG-4PB-ineo轉(zhuǎn)基因豬，創(chuàng)建了piggyBac轉(zhuǎn)基因突變豬新材料。該方法被證明是實現(xiàn)高效、簡便、低成本的豬規(guī)?；蛲蛔兊挠行緩剑瑢O大的促進家畜育種及醫(yī)學新藥的發(fā)展。

中期檢查專家組認為，經(jīng)過兩年多的研究，“豬重要經(jīng)濟性狀的功能基因組學研究”課題組在豬功能基因組學研究工具與平臺完善、豬基因組結(jié)構(gòu)解析及生長、肉質(zhì)等經(jīng)濟性狀組學解析方面取得了較大進展，對實現(xiàn)我國動物育種重大理論和關鍵技術突破，提高我國豬功能基因組研究水平和自主創(chuàng)新能力具有重要的現(xiàn)實意義。